Bioconductor版本:版本(3.15)
apeglm提供了贝叶斯估计收缩效应大小不同的全球语言监测机构模型,使用后对个人的近似系数。
作者:Anqi朱(aut (cre),约书亚Zitovsky(施),迈克尔·约瑟夫·易卜拉欣(aut)爱(aut)
维修工:朱Anqi < anqizhu live.unc.edu >
从内部引用(R,回车引用(“apeglm”)):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“apeglm”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“apeglm”)
| HTML | R脚本 | 与apeglm效果评估 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
| biocViews | 贝叶斯,DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件 |
| 版本 | 1.18.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(4.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | |
| 进口 | emdbook,SummarizedExperiment,GenomicRanges、方法、统计跑龙套,Rcpp |
| 链接 | Rcpp,RcppEigen,RcppNumerical |
| 建议 | DESeq2,气道,knitr,rmarkdown,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | rnaseqGene |
| 进口我 | airpart,debrowser,DiffBind,TEKRABber |
| 建议我 | bambu,BRGenomics,DESeq2,鱼池,NanoporeRNASeq |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | apeglm_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | apeglm_1.18.0.zip(64位) |
| macOS 10.13(高山脉) | apeglm_1.18.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/apeglm |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ apeglm |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/apeglm/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |