alevinQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.alevinQC

为Alevin输出生成QC报告

Bioconductor版本:发行版(3.16)

生成汇总alevin运行输出的QC报告。报告可以生成为html或pdf文件，也可以生成为闪亮的应用程序。

作者:Charlotte Soneson [aut, cre]，阿维·斯里瓦斯塔瓦[aut]，罗伯·帕特罗[aut]，何东泽[aut]

维护人员:Charlotte Soneson

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("alevinQC")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“alevinQC”)

超文本标记语言	R脚本	alevinQC
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	质量控制，SingleCell，软件
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.0)
进口	rmarkdown(>= 2.5)，工具，方法，ggplot2，GGally，dplyr，rjson，闪亮的，shinydashboard，DT,统计,跑龙套,tximport(> = 1.17.4),cowplot，rlang，Rcpp
链接	Rcpp
建议	knitr，BiocStyle，testthat(> = 3.0.0),BiocManager
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/csoneson/alevinQC
BugReports	https://github.com/csoneson/alevinQC/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	alevinQC_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	alevinQC_1.14.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	alevinQC_1.14.0.tgz
macOS二进制(arm64)	alevinQC_1.13.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alevinQC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ alevinQC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/alevinQC/
包下载报告	下载数据