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SCnorm
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SCnorm
单细胞RNA-seq数据的标准化
Bioconductor版本:版本(3.16)
这个包实现SCnorm——方法规范化单细胞RNA-seq数据。
作者:朗达巴彻
维护人员:朗达巴彻< rbacher ufl.edu >
从内部引用(R,回车引用(“SCnorm”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SCnorm”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SCnorm”)
| R脚本 | SCnorm装饰图案 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ImmunoOncology,归一化,RNASeq,SingleCell,软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.4.0) |
| 进口 | SingleCellExperiment,SummarizedExperiment、数据、方法、图形、grDevices平行,quantreg,集群,时刻,data.table,BiocParallel,S4Vectors,ggplot2,forcats,BiocGenerics |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,devtools |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/rhondabacher/SCnorm |
| BugReports | https://github.com/rhondabacher/SCnorm/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SCnorm_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SCnorm_1.20.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | SCnorm_1.20.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | SCnorm_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCnorm |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SCnorm |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SCnorm/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SCnorm/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
