SC3

DOI:10.18129 / B9.bioc.SC3

单细胞共识聚类

Bioconductor版本:发行版(3.16)

用于单细胞RNA-Seq数据的无监督聚类和分析的工具。

作者:Vladimir Kiselev

维护者:Vladimir Kiselev < Vladimir .yu。Kiselev在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SC3”)

超文本标记语言	R脚本	SC3包装手册
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	分类，聚类，DataRepresentation，DifferentialExpression，DimensionReduction，GUI，ImmunoOncology，RNASeq，SingleCell，软件，SupportVectorMachine，转录，转录组，可视化
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3)
进口	图形，统计，utils，方法，e1071平行,foreach，doParallel，doRNG，闪亮的，ggplot2，pheatmap(> = 1.0.8),ROCR，robustbase，rrcov，集群，WriteXLS，Rcpp(> = 0.11.1),SummarizedExperiment，SingleCellExperiment，BiocGenerics，S4Vectors
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	knitr，rmarkdown，mclust，嘘
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/hemberg-lab/SC3
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/sc3/
全靠我
进口我	盛宴
建议我	InteractiveComplexHeatmap，scTreeViz，VAExprs
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SC3_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	SC3_1.26.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	SC3_1.26.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	SC3_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SC3
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SC3
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SC3/
软件包下载报告	下载数据