RCX

DOI:10.18129 / B9.bioc.RCX

R包，实现Cytoscape Exchange (CX)格式

Bioconductor版本:发行版(3.16)

以Cytoscape交换(CX)格式创建、处理、验证、可视化并将网络转换为标准数据类型和对象。该包还提供了与iGraph和graphNEL对象之间的转换。CX格式也被NDEx平台(生物网络的在线共享平台)和网络可视化软件Cytocape所使用。

作者:Florian Auer [aut, cre]

维护者:Florian Auer < Florian。奥氏小体在informatik.uni-augsburg.de >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RCX")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“RCX”)

超文本标记语言	R脚本	01.RCX -实现Cytoscape Exchange (CX)格式的R包
超文本标记语言	R脚本	02.从头开始创建RCX
超文本标记语言	R脚本	03.扩展RCX数据模型
超文本标记语言	R脚本	附录:RCX和CX数据模型
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，网络，通路，软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.2.0)
进口	jsonlite，plyr，igraph、方法
链接
建议	BiocStyle，testthat，knitr，rmarkdown，base64enc，图
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/frankkramer-lab/RCX
BugReports	https://github.com/frankkramer-lab/RCX/issues
取决于我	ndexr
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	RCX_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	RCX_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	RCX_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)	RCX_1.1.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RCX
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RCX
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RCX/
包下载报告	下载数据