RCM

DOI:10.18129 / B9.bioc.RCM

用负二项分布拟合微生物组的行-列关联模型

Bioconductor版本:发行版(3.16)

结合列联表对数线性分析、柔性响应函数估计和经验贝叶斯色散估计的思想，对微生物组数据集进行探索性可视化。该软件包包括无约束分析和有约束分析。此外，还可用诊断图检测拟合不足。

作者:Stijn Hawinkel

维护者:Stijn Hawinkel < Stijn。在psb.ugent.be hawinkel >

安装

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如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RCM")

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超文本标记语言	R脚本	RCM包的手册
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细节

biocViews	DimensionReduction，宏基因组，微生物组，软件，可视化
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.0),DBI
进口	RColorBrewer，阿拉巴马州，刨边机，reshape2，tseries统计数据,VGAM，ggplot2(> = 2.2.1.9000),nleqslv，phyloseq，张量，质量grDevices，图形，方法
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/vignettes/RCM/inst/doc/RCMvignette.html/
BugReports	https://github.com/CenterForStatistics-UGent/RCM/issues
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包档案

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源包	RCM_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	RCM_1.14.0.zip
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RCM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RCM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RCM/
包下载报告	下载数据