PanomiR

DOI:10.18129 / B9.bioc.PanomiR

调控相互作用通路组的miRNAs的检测

Bioconductor版本:发行版(3.16)

PanomiR是一个包，用于从基因表达数据中检测靶向通路组的miRNAs。该包提供了生成通路活性概况、在用户指定的条件下确定差异激活的通路、通过PCxN包确定通路集群和生成靶向通路集群的miRNAs的功能。这些功能可以单独使用，也可以依次用于分析RNA-Seq数据。

作者:Pourya Naderi [aut, cre]，岳阳(Alan) Teo [aut]， Ilya Sytchev [aut]， Winston Hide [aut]

维护者:Pourya Naderi

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("PanomiR")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“PanomiR”)

超文本标记语言	R脚本	PanomiR教程
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneExpression，GeneSetEnrichment，GeneTarget，通路，软件，microrna的
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.2.0)
进口	clusterProfiler，dplyr，forcats，GSEABase，igraph，limma，metap，org.Hs.eg.db平行,preprocessCore，RColorBrewer，rlang，宠物猫，withr,跑龙套
链接
建议	testthat(> = 3.0.0),BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/pouryany/PanomiR
BugReports	https://github.com/pouryany/PanomiR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	PanomiR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	PanomiR_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	PanomiR_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PanomiR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PanomiR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PanomiR/
包下载报告	下载数据