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食人魔
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DOI:10.18129 / B9.bioc.OGRE
计算，可视化和分析基因组区域之间的重叠
Bioconductor版本:发行版(3.16)
OGRE计算用户定义的基因组区域数据集之间的重叠。任何区域都可以提供，即基因，snp，或测序实验的reads。关键数字有助于分析重叠的延伸，也可以在基因组水平上可视化。
作者:Sven Berres [aut, cre]， Jörg Gromoll [ctb]， Marius Wöste [ctb]， Sarah Sandmann [ctb]， Sandra Laurentino [ctb]
维护者:Sven Berres
引文(从R内，输入引用(“食人魔”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“食人魔”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 食人魔 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释，BiologicalQuestion，宏基因组，测序，软件，可视化，WorkflowStep |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 4.1.0)，S4Vectors |
| 进口 | GenomicRanges、方法、data.table，为了，ggplot2，Gviz，IRanges，AnnotationHub， grDevices, stats，GenomeInfoDb，闪亮的，shinyFiles，DT，rtracklayer，shinydashboard，shinyBS，tidyr |
| 链接 | |
| 建议 | testthat(> = 3.0.0),knitr(> = 1.36),rmarkdown(> = 2.11) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/svenbioinf/OGRE/ |
| BugReports | https://github.com/svenbioinf/OGRE/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | OGRE_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | OGRE_1.2.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | OGRE_1.2.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | OGRE_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OGRE |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/OGRE |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/OGRE/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
