NanoStringNCTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoStringNCTools

NanoString nCounter工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

纳米串技术的工具nCounter技术。提供将RCC文件读入ExpressionSet派生对象的支持。还包括用于NanoString数据的QC和规范化的方法。

作者:Patrick Aboyoun [aut]， Nicole Ortogero [cre]， Zhi Yang [ctb]

维护者:Nicole Ortogero

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("NanoStringNCTools")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“NanoStringNCTools”)

超文本标记语言	R脚本	nanostringgrccset类简介
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays，DataImport，GeneExpression，ProprietaryPlatforms，蛋白质组学，RNASeq，软件，转录，转录组，mRNAMicroarray
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	麻省理工学院
取决于	R (> = 3.6),Biobase，S4Vectors，ggplot2
进口	BiocGenerics，Biostrings，ggbeeswarm，ggiraph，ggthemesgrDevices,IRanges、方法、pheatmap，RColorBrewer统计,跑龙套
链接
建议	biovizBase，ggbio，RUnit，rmarkdown，knitr，qpdf
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	GeomxTools，GeoMxWorkflows
进口我	GeoDiff
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	NanoStringNCTools_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	NanoStringNCTools_1.6.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	NanoStringNCTools_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64)	NanoStringNCTools_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringNCTools
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NanoStringNCTools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NanoStringNCTools/
包下载报告	下载数据