MuData

DOI:10.18129 / B9.bioc.MuData

MultiAssayExperiment对象的序列化

Bioconductor版本:发行版(3.16)

将multiassayexperiment保存到muon和mudata支持的h5mu文件中。Muon是一个用于多模态组学数据分析的Python框架。它使用基于hdf5的格式进行数据存储。

作者:Danila Bredikhin， Ilia Kats [aut]

维护者:Danila Bredikhin < Danila。Bredikhin at embl.de>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MuData")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“MuData”)

超文本标记语言	R脚本	Blood CITE-seq与MuData
超文本标记语言	R脚本	脐带血CITE-seq与MuData
超文本标记语言	R脚本	我们从MuDataMae开始
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细节

biocViews	DataImport，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor公司	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	矩阵，S4Vectors，rhdf5
进口	方法、统计数据MultiAssayExperiment，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，DelayedArray
链接
建议	HDF5Array，rmarkdown，knitr，fs，testthat，BiocStyle，covr，SingleCellMultiModal，CiteFuse，嘘
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ilia-kats/MuData
BugReports	https://github.com/ilia-kats/MuData/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MuData_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	MuData_1.2.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	MuData_1.2.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MuData_1.1.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/MuData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MuData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MuData/
软件包下载报告	下载数据