MsCoreUtils

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsCoreUtils

质谱数据核心工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

MsCoreUtils定义了质谱数据的低级函数，独立于任何高级数据结构。这些函数包括质谱处理函数(噪声估计，平滑，分组)，定量聚合函数(中位数打磨，稳健总结，…)，缺失数据归一化，数据归一化(分位数，vsn，…)以及misc辅助函数，这些函数在质谱包的R中跨高级数据结构使用。

作者:rformassspectra软件包维护人员[cre]， Laurent Gatto [aut]，约翰内斯·莱纳[法国]，塞巴斯蒂安·吉布[au]， Adriaan Sticker [ctb]， Sigurdur Smarason [ctb]， Thomas Naake [ctb]， Josep Maria Badia Aparicio [ctb]，迈克尔·威廷[ctb]， Samuel Wieczorek [ctb]

维护者:rformassspectra Package Maintainer < rformassspectrometry.org>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MsCoreUtils")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“MsCoreUtils”)

超文本标记语言	R脚本	质谱数据核心工具
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施，MassSpectrometry，代谢组学，蛋白质组学，软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (R-4.0)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	方法,S4Vectors，质量统计数据,线索
链接	Rcpp
建议	testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown，roxygen2，imputeLCMD，嫁祸于，规范，pcaMethods，vsn，矩阵，preprocessCore，missForest
SystemRequirements
增强了	HDF5Array
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsCoreUtils
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsCoreUtils/issues
取决于我
进口我	CompoundDb，MetaboAnnotation，MetaboCoreUtils，MetCirc，MsBackendMassbank，MsBackendMgf，MsBackendMsp，MsBackendRawFileReader，MsFeatures，MSnbase，PSMatch，QFeatures，qmtools，scp，光谱，xcms
建议我	MetNet，msqrob2
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MsCoreUtils_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	MsCoreUtils_1.10.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MsCoreUtils_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MsCoreUtils_1.9.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsCoreUtils
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MsCoreUtils
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsCoreUtils/
包下载报告	下载数据