MsBackendMsp

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendMsp

NIST msp文件的质谱数据后端

Bioconductor版本:发行版(3.16)

质谱(MS)数据后端，支持从NIST MSP格式(MSP)文件导入和处理MS/MS谱。支持从不同MSP * flavor *的文件中导入数据。此包中的对象为Bioconductor的Spectra包添加了对MSP文件的支持。因此，如果没有为MS数据处理提供完整基础设施的Spectra包，则不应该使用此包。

作者:Neumann Steffen [aut]，约翰内斯·雷纳[aut, cre]，迈克尔·威廷[ctb]

维护者:Johannes Rainer

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MsBackendMsp”)

超文本标记语言	R脚本	MsBackendMsp
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，基础设施，MassSpectrometry，代谢组学，蛋白质组学，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1.0)，光谱(> = 1.5.14)
进口	BiocParallel，S4Vectors，IRanges，MsCoreUtils、方法、统计
链接
建议	testthat，knitr(> = 1.1.0版),roxygen2，BiocStyle(> = 2.5.19),rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMsp
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMsp/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MsBackendMsp_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	MsBackendMsp_1.2.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	MsBackendMsp_1.2.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MsBackendMsp_1.1.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMsp
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsBackendMsp
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendMsp/
软件包下载报告	下载数据