MsBackendMgf

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendMgf

吉祥物通用格式(mgf)文件的质谱数据后端

Bioconductor版本:发行版(3.16)

质谱(MS)数据后台支持从Mascot通用格式(mgf)文件导入和导出MS/MS谱数据。这个包中定义的对象应该与Spectra Bioconductor包一起使用。这个包因此增加了mgf文件支持光谱包。

作者:rformassspectra Package Maintainer [cre]， Laurent Gatto [aut]，约翰·雷纳[au]，塞巴斯蒂安·吉布[au]

维护者:rformassspectrometry.org的rformassspectrometry.org维护者<维护者

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MsBackendMgf")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MsBackendMgf”)

超文本标记语言	R脚本	MsBackendMgf的描述和使用
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，基础设施，MassSpectrometry，代谢组学，蛋白质组学，软件
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0)，光谱(> = 1.5.14)
进口	BiocParallel，S4Vectors，IRanges，MsCoreUtils、方法、统计
链接
建议	testthat，knitr(> = 1.1.0版),roxygen2，BiocStyle(> = 2.5.19),rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMgf
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMgf/issues
全靠我
进口我
建议我	CompoundDb，MsBackendRawFileReader，xcms
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MsBackendMgf_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	MsBackendMgf_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	MsBackendMgf_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MsBackendMgf_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMgf
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsBackendMgf
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendMgf/
软件包下载报告	下载数据