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MetaboSignal
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DOI:10.18129 / B9.bioc.MetaboSignal
代谢信号:一种基于网络的方法，覆盖和探索代谢和信号KEGG通路
Bioconductor版本:发行版(3.16)
metabolsignal是一个R包，允许合并，分析和定制代谢和信号KEGG通路。它是一种基于网络的方法，旨在探索基因(信号-或酶-基因)和代谢物之间的拓扑关系，代表了一个强大的工具来研究遗传景观和代谢表型的调节网络。
作者:Andrea Rodriguez-Martinez, Rafael Ayala, Joram M. Posma, Ana L. Neves, Maryam Anwar, Jeremy K. Nicholson, Marc-Emmanuel Dumas
维护者:Andrea Rodriguez-Martinez < Andrea。罗德里格斯-马丁内兹13在imperial.ac。英国>，Rafael Ayala
引文(从R内，输入引用(“MetaboSignal”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“MetaboSignal”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | MetaboSignal |
| 超文本标记语言 | R脚本 | 代谢信号2:合并KEGG与额外的交互资源 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneSignaling，GeneTarget，GraphAndNetwork，KEGG，网络，通路，Reactome，软件 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(6年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 3.3) |
| 进口 | KEGGgraph，hpar，igraph，RCurl，KEGGREST，EnsDb.Hsapiens.v75，统计，图形，utils，org.Hs.eg.db，biomaRt，AnnotationDbi，MWASTools，mygene |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit，BiocGenerics，knitr，BiocStyle，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | MetaboSignal_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MetaboSignal_1.28.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | MetaboSignal_1.28.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | MetaboSignal_1.28.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MetaboSignal |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MetaboSignal |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MetaboSignal/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
