MassSpecWavelet

DOI:10.18129 / B9.bioc.MassSpecWavelet

基于小波算法的质谱数据峰值检测

Bioconductor版本:发行版(3.16)

质谱数据的峰检测是质谱数据预处理的重要步骤之一。峰值检测的性能影响后续过程，包括蛋白质识别、剖面对齐和生物标志物识别。该软件包使用连续小波变换(CWT)，提供了一个可靠的峰值检测算法，不需要任何类型的平滑或之前的基线校正方法，为不同的光谱提供了更一致的结果。看到

作者:杜潘[aut]，沃伦·基贝[aut]，林西蒙[aut]，塞尔吉奥·奥勒·莫雷诺[aut, cre]

维护者:Sergio Oller Moreno

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MassSpecWavelet")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“MassSpecWavelet”)

超文本标记语言	R脚本	找到当地的最大值
超文本标记语言	R脚本	使用MassSpecWavelet包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology，MassSpectrometry，PeakDetection，蛋白质组学，软件
版本	1.64.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (R-2.5)(15.5年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于
进口
链接
建议	信号，waveslim，BiocStyle，knitr，rmarkdown，RUnit，板凳上
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/zeehio/MassSpecWavelet
BugReports	http://github.com/zeehio/MassSpecWavelet/issues
取决于我
进口我	cosmiq，xcms
建议我	downlit
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MassSpecWavelet_1.64.0.tar.gz
Windows二进制	MassSpecWavelet_1.64.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MassSpecWavelet_1.64.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MassSpecWavelet_1.63.6.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MassSpecWavelet
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MassSpecWavelet
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MassSpecWavelet/
包下载报告	下载数据