餐
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DOI:10.18129 / B9.bioc.MEAL
进行甲基化分析
Bioconductor版本:发行版(3.16)
包集成甲基化和表达数据。它还可以单独进行甲基化或表达分析。包含了一些绘图功能以及基于冗余分析的新的区域分析。snp对一个区域的影响也可以估计出来。
作者:Carlos Ruiz-Arenas [aut, cre]， Juan R. Gonzalez [aut]
维护者:Xavier Escribà Montagut
引用(从R中，输入引用(“餐”))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MEAL")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“餐”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | MEAL的表达和甲基化分析 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | 用MEAL进行甲基化分析 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | DNAMethylation，微阵列，软件，WholeGenome |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 3.2 (R-3.2)(7年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 3.6.0)，Biobase，MultiDataSet |
| 进口 | GenomicRanges，limma，素食主义者，BiocGenerics，minfi，IRanges，S4Vectors方法，并行，ggplot2(> = 2.0.0),交换，Gviz，missMethyl，isva，SummarizedExperiment，SmartSVA，图形，统计，工具，matrixStats |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19，IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19，knitr，minfiData，BiocStyle，rmarkdown，brgedata |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 给我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | MEAL_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MEAL_1.28.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | MEAL_1.28.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | MEAL_1.28.0.tgz |
| 源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/MEAL |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MEAL |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MEAL/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
| bioc3.16的旧源包 | 源存档 |
