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MBECS
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DOI:10.18129 / B9.bioc.MBECS
微生物组数据集中批处理效应的评价与校正
Bioconductor版本:发行版(3.16)
微生物组批量效应校正套件(MBECS)提供了一组函数来评估和减轻由于批量处理而产生的未水噪声。为此，它从不同的包中集成了大量的批处理校正算法(BECA)。此外，它还提供了一个修正和报告管道，可以初步了解修正批处理效应前后数据集的特征。
作者:Michael Olbrich [aut, cre]
维护者:Michael Olbrich
引用(从R中，输入引用(“MBECS”))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MBECS")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“MBECS”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | MBECS介绍 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BatchEffect，微生物组，归一化，质量控制，ReportWriting，软件，可视化 |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 4.1) |
| 进口 | 方法,magrittr，phyloseq，limma，lme4，lmerTest，pheatmap，rmarkdown，集群，dplyr，ggplot2，gridExtra，ruv，股东价值分析，宠物猫，tidyr，素食主义者,统计,跑龙套,矩阵 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，减价，BiocStyle，testthat(> = 3.0.0) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/rmolbrich/MBECS |
| BugReports | https://github.com/rmolbrich/MBECS/issues/new |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | MBECS_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MBECS_1.2.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBECS |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MBECS |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MBECS/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
