感兴趣

DOI:10.18129 / B9.bioc.IntEREst

Intron-Exon保留估计量

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这个包对RNA-seq数据进行内含子-外显子保留分析。bam文件)。

作者:Ali Oghabian ，达里奥·格列柯<达里奥。希腊在赫尔辛基。fi>， Mikko Frilander

维护者:Ali Oghabian ， Mikko Frilander

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("IntEREst")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“利益”)

超文本标记语言	R脚本	兴趣，内含子外显子保留估计器
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，AlternativeSplicing，报道，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，ImmunoOncology，归一化，RNASeq，测序，软件
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.5.0),GenomicRanges，Rsamtools，SummarizedExperiment，刨边机，S4Vectors
进口	seqLogo，Biostrings，GenomicFeatures(> = 1.39.4),IRanges，seqinr、图形、grDevices、统计、utils、网格、方法、DBI，RMySQL，GenomicAlignments，BiocParallel，BiocGenerics，DEXSeq，DESeq2
链接
建议	clinfun，knitr，rmarkdown，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	IntEREst_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	IntEREst_1.22.0.zip
macOS二进制(x86_64)	IntEREst_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64)	IntEREst_1.21.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IntEREst
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/利益
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IntEREst/
包下载报告	下载数据