IgGeneUsage

DOI:10.18129 / B9.bioc.IgGeneUsage

不同基因在免疫系统中的应用

Bioconductor版本:发行版(3.16)

检测免疫球蛋白(Ig)基因使用的偏差是免疫谱分析中的一项重要任务。IgGeneUsage检测异常的Ig基因使用之间的生物条件使用概率模型，这是由贝叶斯推理计算分析。这样IgGeneUsage也避免了一些与当前零假设显著性检验实践相关的常见问题。

作者:Simo Kitanovski [aut, cre]

维护者:Simo Kitanovski < Simo。基塔诺夫斯基在uni-due.de>

安装

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如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

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文档

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browseVignettes(“IgGeneUsage”)

超文本标记语言	R脚本	用户手册:IgGeneUsage
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯，BiomedicalInformatics，DifferentialExpression，遗传学，ImmunoOncology，MathematicalBiology，回归，软件
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(3年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.2.0)
进口	方法,reshape2(> = 3),Rcpp(> = 0.12.0),RcppParallel(> = 5.0.1),rstan(> = 2.18.1),rstantools(> = 2.2.0),SummarizedExperiment
链接	黑洞(> = 1.66.0),Rcpp(> = 0.12.0),RcppEigen(> = 0.3.3.3.0),RcppParallel(> = 5.0.1),rstan(> = 2.18.1),StanHeaders(> = 2.18.0)
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat(> =魅惑,ggplot2，ggforce，gridExtra，ggrepel
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL	https://github.com/snaketron/IgGeneUsage
BugReports	https://github.com/snaketron/IgGeneUsage/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	IgGeneUsage_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	IgGeneUsage_1.12.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	IgGeneUsage_1.12.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	IgGeneUsage_1.11.10.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IgGeneUsage
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/IgGeneUsage
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IgGeneUsage/
软件包下载报告	下载数据