Bioconductor版本:发行版(3.16)
HubPub为用户提供功能,以帮助Bioconductor Hub结构。该包提供了创建Hub样式包的框架的能力,然后用户可以用必要的信息填充该框架。还有一些函数可以帮助向Hub包元数据文件添加资源,以及将数据发布到Bioconductor S3 bucket。
作者:Kayla Interdonato [aut, cre], Martin Morgan [aut]
维护者:Kayla Interdonato < Kayla。roswellpark.org>
引文(从R内,输入引用(“HubPub”)):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“HubPub”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 创建一个中心包:ExperimentHub或AnnotationHub |
| 超文本标记语言 | R脚本 | HubPub:帮助发布Hub包 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
| biocViews | DataImport,基础设施,软件,ThirdPartyClient |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | |
| 进口 | 可用,usethis,biocthis,dplyr,aws.s3,fs,BiocManager,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | AnnotationHubData,ExperimentHubData,testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/Bioconductor/HubPub/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | AnnotationHub,AnnotationHubData,ExperimentHub,ExperimentHubData |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | HubPub_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | HubPub_1.6.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | HubPub_1.6.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | HubPub_1.5.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HubPub |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HubPub |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HubPub/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |