HPAStainR

DOI:10.18129 / B9.bioc.HPAStainR

查询多种蛋白质和基因的人类蛋白质图谱染色数据

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这个包是围绕HPAStainR函数构建的。HPAStainR函数的目的是查询Human Protein Atlas中的可视化染色数据，返回染色排序的细胞类型表。该函数还有多个参数可个性化输出，包括癌症数据、csv可读名称、修改结果的置信级别等。其他函数专门用于轻松获取运行HPAStainR所需的数据。

作者:Tim O. Nieuwenhuis [aut, cre]

维护者:Tim O. Nieuwenhuis

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“HPAStainR”)

超文本标记语言	R脚本	HPAStainR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GeneSetEnrichment，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1.0)，dplyr，tidyr
进口	跑龙套,统计数据,尺度，stringr，宠物猫，闪亮的，data.table
链接
建议	knitr，BiocManager，qpdf，hpar，testthat，rmarkdown
SystemRequirements	4GB内存
增强了
URL
BugReports	https://github.com/tnieuwe/HPAstainR
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	HPAStainR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	HPAStainR_1.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	HPAStainR_1.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	HPAStainR_1.7.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HPAStainR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HPAStainR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HPAStainR/
软件包下载报告	下载数据