EnrichedHeatmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.EnrichedHeatmap

制作丰富的热图

Bioconductor版本:发行版(3.16)

富集热图是一种特殊类型的热图，可以可视化地显示基因组信号在特定靶区域的富集情况。这里我们通过ComplexHeatmap包实现了丰富的热图。由于这种类型的热图只是普通的热图，但有一些特殊的设置，通过ComplexHeatmap的功能，定制热图以及连接到热图列表以显示不同数据源之间的对应关系将容易得多。

作者:顾祖光[aut, cre]

维护人员:Zuguang Gu

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("EnrichedHeatmap")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“EnrichedHeatmap”)

超文本标记语言	R脚本	1.制作丰富的热图
超文本标记语言	R脚本	2.可视化分类信号
超文本标记语言	R脚本	3.比较行排序方法
超文本标记语言	R脚本	4.在路线图数据集中可视化综合关联
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	报道，GenomeAnnotation，测序，软件，可视化
版本	1.27.2
在Bioconductor公司	BioC 3.2 (R-3.2)(7年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R(>= 3.6.0)，方法，网格，ComplexHeatmap(> = 2.11.0),GenomicRanges
进口	matrixStats统计数据,GetoptLong，Rcpp跑龙套,locfit，circlize(> = 0.4.5),IRanges
链接	Rcpp
建议	testthat(> = 0.3),knitr，减价，rmarkdown，genefilter，RColorBrewer
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/EnrichedHeatmap
全靠我
进口我	extraChIPs，profileplyr
建议我	ComplexHeatmap，epistack，InteractiveComplexHeatmap
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	EnrichedHeatmap_1.27.2.tar.gz
Windows二进制	EnrichedHeatmap_1.27.2.zip
macOS二进制文件(x86_64)	EnrichedHeatmap_1.27.2.tgz
macOS二进制文件(arm64)	EnrichedHeatmap_1.28.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/EnrichedHeatmap
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EnrichedHeatmap
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EnrichedHeatmap/
软件包下载报告	下载数据