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Doscheda
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DOI:10.18129 / B9.bioc.Doscheda
下游化学蛋白质组学分析管道
Bioconductor版本:发行版(3.16)
Doscheda专注于定量化学蛋白质组学，用于使用质谱数据从全细胞或组织裂解物中确定小分子的蛋白质相互作用谱。该软件包提供了一个闪亮的应用程序来运行管道，几个可视化和一个可下载的实验报告。
作者:Bruno Contrino, Piero Ricchiuto
维护者:Bruno Contrino
引文(从R内，输入引用(“Doscheda”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“Doscheda”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | Doscheda |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataImport，MassSpectrometry，归一化，预处理，蛋白质组学，质量控制，回归，软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 3.4) |
| 进口 | 方法,刚果民主共和国统计数据,httr，jsonlite，reshape2，vsn，affy，limma，stringr，ggplot2，图形，grDevices，校准，corrgram，gridExtra，DT，闪亮的，shinydashboard，readxl，prodlim，matrixStats |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | Doscheda_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Doscheda_1.20.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | Doscheda_1.20.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | Doscheda_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Doscheda |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Doscheda |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/Doscheda/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Doscheda/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
