ClusterSignificance

DOI:10.18129 / B9.bioc.ClusterSignificance

ClusterSignificance包提供了工具来评估降维数据表示中的类集群是否与排列数据有分离

Bioconductor版本:发行版(3.16)

ClusterSignificance包提供了工具来评估降维数据表示中的类集群是否与排列数据有分离。这里的类簇指的是表示数据中已知类的点簇。这对于确定变量的一个子集(例如特定途径中的基因)是否可以单独将样本分为这些已建立的类别特别有用。ClusterSignificance通过将所有点投影到一维线上来实现这一点。然后对聚类分离进行评分，并使用排列方法评估由于偶然性而看到的分离的概率。

作者:Jason T. Serviss [aut, cre]， Jesper R. Gadin [aut]

维护者:Jason T Serviss < Jason。服务地点:kiss .se>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ClusterSignificance”)

超文本标记语言	R脚本	ClusterSignificance装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类，聚类，PrincipalComponent，软件，StatisticalMethod
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3.0)
进口	方法,pracma，princurve(> = 2.0.5),scatterplot3d，RColorBrewer， grDevices，图形，utils，统计
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat，BiocStyle，ggplot2，plsgenomics，covr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jasonserviss/ClusterSignificance/
BugReports	https://github.com/jasonserviss/ClusterSignificance/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ClusterSignificance_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	ClusterSignificance_1.26.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ClusterSignificance_1.26.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ClusterSignificance_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ClusterSignificance
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ClusterSignificance
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ClusterSignificance/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ClusterSignificance/
软件包下载报告	下载数据