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CHRONOS
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DOI:10.18129 / B9.bioc.CHRONOS
克罗诺斯以一条时变方法:microRNA-mediated sub-pathway富集分析
Bioconductor版本:版本(3.17)
包用于有效的途径解开的固有动态属性。MicroRNA-mediated subpathway拓扑提取并利用评估的时间过渡和褶皱的变化活动/小分子核糖核酸基因有关。
作者:Aristidis g . Vrahatis Konstantina Dimitrakopoulou,帕诺斯Balomenos
维护人员:帕诺斯Balomenos < Balomenos在upatras.gr >
从内部引用(R,回车引用(“CHRONOS”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CHRONOS”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“CHRONOS”)
| R脚本 | CHRONOS | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GraphAndNetwork,KEGG,通路,软件,SystemsBiology |
| 版本 | 1.28.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(7年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.5) |
| 进口 | XML、RCurlRBGL、并行foreach doParallel、openxlsx igraph, circlize,图,统计,跑龙套,grDevices、图形的方法,biomaRt,rJava |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics、knitr rmarkdown |
| SystemRequirements | Java版本> = 1.7,Pandoc |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | CHRONOS_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CHRONOS_1.28.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | CHRONOS_1.28.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CHRONOS |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CHRONOS |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/CHRONOS/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CHRONOS/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
