BiocCheck

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocCheck

Bioconductor-specific包检查

Bioconductor版本:发行版(3.16)

BiocCheck通过Bioconductor最佳实践指导维护者。它通过搜索包代码、示例和小插图来运行特定于bioconductor的包检查。维护人员需要处理所有错误、警告和产生的大多数注释。

作者:Bioconductor Package Maintainer [aut]， Lori Shepherd [aut]， Daniel von Twisk [ctb]， Kevin Rue [ctb]， Marcel Ramos [aut, cre]，莱昂纳多·科拉多-托雷斯[ctb]，费德里科·马里尼[ctb]

维护者:Marcel Ramos < Marcel。拉莫斯在roswellpark.org >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BiocCheck")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“BiocCheck”)

超文本标记语言	R脚本	BiocCheck:确保Bioconductor包装指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施，软件
版本	1.34.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (R-3.1)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.2.0)
进口	biocViews(> = 1.33.7),BiocManager，stringdist，图，httr、工具、codetools、方法、跑龙套knitr
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，Biobase，jsonlite，rmarkdown，下载器，devtools(> = 1.4.1),usethis，BiocStyle，callr
SystemRequirements
增强了	codetoolsBioC
URL	https://github.com/Bioconductor/BiocCheck
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocCheck/issues
取决于我
进口我	AnnotationHubData
建议我	GEOfastq，HMP16SData，HMP2Data，packFinder，preciseTAD，scpdata，SpectralTAD
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	BiocCheck_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	BiocCheck_1.33.20.zip
macOS二进制(x86_64)	BiocCheck_1.34.0.tgz
macOS二进制(arm64)	BiocCheck_1.33.20.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocCheck
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BiocCheck
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocCheck/
包下载报告	下载数据