BEclear

DOI:10.18129 / B9.bioc.BEclear

DNA甲基化数据中批处理效应的修正

Bioconductor版本:发行版(3.16)

提供检测和纠正DNA甲基化数据中的批处理效应的功能。核心函数基于潜在因子模型，也可用于预测任何其他包含实数的矩阵中的缺失值。

作者:大卫·拉斯普， Markus Merl [aut]， Ruslan Akulenko [aut]

维护者:David Rasp < David .j。粗声粗气地说:gmail.com >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" clear")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“BEclear”)

超文本标记语言	R脚本	BEclear教程
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BatchEffect，DNAMethylation，预处理，软件，StatisticalMethod
版本	2.14.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (R-3.2)(7.5年)
许可证	GPL-3
取决于	BiocParallel(> = 1.14.2)
进口	futile.logger，Rdpack，矩阵，data.table(> = 1.11.8),Rcpp，abind，统计，图形，工具，方法，dixonTest，id
链接	Rcpp
建议	testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown，老鸨，seewave
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/uds-helms/BEclear
BugReports	https://github.com/uds-helms/BEclear/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	BEclear_2.14.0.tar.gz
Windows二进制	BEclear_2.14.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	BEclear_2.14.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BEclear
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BEclear
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BEclear/
包下载报告	下载数据