AnnotationHubData

DOI:10.18129 / B9.bioc.AnnotationHubData

将公共数据资源转换为Bioconductor数据结构

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这些配方将种类繁多且数量不断增长的公共生物信息数据集转换为易于使用的标准Bioconductor数据结构。

作者:Martin Morgan [ctb]， Marc Carlson [ctb]， Dan Tenenbaum [ctb]， Sonali Arora [ctb]， Paul Shannon [ctb]， Lori Shepherd [ctb]， Bioconductor包装维护员[cre]

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("AnnotationHubData")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“AnnotationHubData”)

超文本标记语言		介绍AnnotationHubData
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文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，软件
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (R-3.2)(7年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.2.2)，方法，utils，S4Vectors(> = 0.7.21),IRanges(> = 2.3.23),GenomicRanges，AnnotationHub(> = 2.15.15)
进口	GenomicFeatures，Rsamtools，rtracklayer，BiocGenerics，jsonlite，BiocManager，biocViews，BiocCheck，图，AnnotationDbi，Biobase，Biostrings，DBI，GenomeInfoDb(> = 1.15.4),OrganismDbi，RSQLite，AnnotationForge，futile.logger1.3.0(> =版本),XML，RCurl
链接
建议	RUnit，knitr，BiocStyle，grasp2db，GenomeInfoDbData，rmarkdown，HubPub
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	ExperimentHubData
进口我	AHEnsDbs，EuPathDB
建议我	GenomicState，HubPub
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	AnnotationHubData_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	AnnotationHubData_1.28.0.zip
macOS二进制(x86_64)	AnnotationHubData_1.28.0.tgz
macOS二进制(arm64)	AnnotationHubData_1.27.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AnnotationHubData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AnnotationHubData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationHubData/
包下载报告	下载数据