cellity

DOI:10.18129 / B9.bioc.cellity

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cellity。

为单细胞RNA-seq数据质量控制

Bioconductor版本:3.9

支持向量机的方法来识别和过滤低质量细胞单细胞RNA-seq数据集。

作者:戴维斯托米斯拉夫•Illicic麦卡锡

维护人员:Tomislav Ilicic < ti243在cam.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cellity”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cellity”)

HTML	R脚本	介绍cellity包
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文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction,GeneExpression,ImmunoOncology,归一化,预处理,质量控制,RNASeq,测序,软件,SupportVectorMachine,转录组,可视化
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(3.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.3)
进口	AnnotationDbi,e1071,ggplot2、图形grDevices、网格mvoutlier,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,robustbase统计数据,topGO,跑龙套
链接
建议	BiocStyle,脱字符号,knitr,testthat,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cellity_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	cellity_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	cellity_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellity
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cellity
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cellity/
包下载报告	下载数据