共识

DOI：10.18129 / b9.bioc.consensusde.

这是发展版本的共识;对于稳定的版本版本，请参阅共识。

使用多种算法进行RNA-SEQ分析

Bioconducts版本：开发（3.14）

此包允许用户使用多种算法执行DE分析。它旨在从多种方法中共识。目前它支持“变量”，“编辑”和“DESEQ”。它使用RUV-SEQ（可选）删除不需要的变化来源。

作者：Ashley J. Waardenberg [Aut，Cre]，Martha M. Cooper [CTB]

维护者：Ashley J. Waardenberg

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squally = true））install.packages（“biocmanager”）＃以下初始化Buoc Devel Biocmanager :: Install（版本='devel'）BiocManager :: Install（“Consensusde”）的使用

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“CANSENSUSDE”）

HTML.	r script.	共识
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	聚类那多匹匹莫森那测序那软件那转录组学
版本	1.11.0.
在生物导体中以来	BIOC 3.8（R-3.5）（2.5岁）
执照	GPL-3.
依靠	r（> = 3.5），生物根系
进口	呼吸道，annotationdbi.那生物相投那BioBase.那生物仪器那data.table.那dendextend.那deseq2.（> = 1.20.0），edaseq.那Ensembldb.那edger.，ensdb.hsapiens.v86，基因管理那基因组法那林马，org.hs.eg.db，pcamethods.那rcolorbrewer.那RSAMTOOLS.那Ruvseq.那S4Vectors.，统计，概括分析，txdb.dmelanogaster.ucsc.dm3.ensgene，Utils
链接到
建议	kn那RAMAMAMDOW.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	consensusde_1.11.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）	consensusde_1.11.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/consensusde.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包裹/共识
包短网址	https://biocumon.org/packages/consensusde/
包裹下载报告	下载统计信息