rrvgo

DOI:10.18129 / B9.bioc.rrvgo

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rrvgo。

减少+想象去

Bioconductor版本:3.12

减少和可视化基因本体术语列表通过识别redudance基于语义相似度。

作者:塞尔吉Sayols (aut (cre)

维护人员:塞尔吉Sayols < sergisayolspuig gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rrvgo”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rrvgo”)

HTML	R脚本	使用rrvgo
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,聚类,去,网络,通路,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	GOSemSim,AnnotationDbi,GO.db,pheatmap,ggplot2,ggrepel,treemap,tm,wordcloud,闪亮的、grDevices、网格数据,方法
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,testthat(> =魅惑,shinydashboard,DT,情节,的热图,magrittr跑龙套,clusterProfiler,剂量,大满贯,org.Ag.eg.db,org.At.tair.db,org.Bt.eg.db,org.Ce.eg.db,org.Cf.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Dr.eg.db,org.EcK12.eg.db,org.EcSakai.eg.db,org.Gg.eg.db,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Mmu.eg.db,org.Pf.plasmo.db,org.Pt.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,org.Ss.eg.db,org.Xl.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/rrvgohttps://ssayols.github.io/rrvgo/index.html
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rrvgo_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	rrvgo_1.2.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	rrvgo_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rrvgo
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rrvgo
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rrvgo/
包下载报告	下载数据