此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅mirnatap。
生物导体版本:3.11
该软件包促进了需要miRNA预测的工作流程的实施,它允许从可在线可用的多个来源中整合排名的miRNA目标预测,并通过各种方法将它们汇总,从而提高预测质量以上任何一个来源。目前,可用于Homo Sapiens,Mus Musculus和Rattus Norvegicus(通过同源性翻译的最后一个)。
作者:Maciej Pajak,T。IanSimpson
维护者:T。Ian Simpson
引用(从r内,输入引用(“ mirnatap”)):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mirnatap”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ mirnatap”)
| R脚本 | mirnatap | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
| 生物浏览 | 分类,,,,微阵列,,,,测序,,,,软件,,,,mirna |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(6年) |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | r(> = 3.3.0),AnnotationDbi |
| 进口 | DBI,,,,rsqlite,,,,Stringr,,,,SQLDF,,,,plyr, 方法 |
| 链接 | |
| 建议 | topgo,,,,org.hs.eg.db,,,,mirnatap.db,,,,测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | mirnatap.db |
| 进口我 | mirnatap.db,,,,蜘蛛网 |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | mirnatap_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | mirnatap_1.22.0.zip |
| MacOS 10.13(高山脉) | mirnatap_1.22.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mirnatap |
| 源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/mirnatap |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/mirnatap/ |
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